کارگاه آموزش زبان برنامه نویسی R در بیوانفورماتیک و شیمی دارویی

زبان برنامه نویسی R

این کارگاه برای زیست شناسانی  که هیچگونه مهارتی در برنامه نویسی R  ندارند، طراحی شده است. R یک محیط برنامه نویسی ساده است که امکان مدیریت موثر داده ها را فراهم می کند و یک پشتیبانی گرافیکی عالی را ارائه می دهد. RStudio نیز ابزاری است که محیطی کاربرپسند برای کار با R را فراهم می کند.

این مطالب برای ارائه یک مرور سریع از زبان برنامه نویسی R در نظر گرفته شده است.

 

مخاطبین	مهارت های محاسباتی مورد نیاز	مدت زمان
زیست شناسان	هیچ	کارگاه 2-3 ساعته برای هر جلسه (این زمان تخمینی است)

بررسی اجمالی

موضوعات

• آمار و تجسم
• مهارتهای پایه برنامه نویسی

سطح مهارت

• مبتدی
• حد واسط
• پیشرفته

شرح برنامه نویسی R

آیا تا به حال خواسته اید مهارت تجسم دیتا را یاد بگیرید؟ با زبان برنامه نویسی R می توانید!

این کارگاه با استفاده از  برنامه نویسی R و RStudio به مبتدیان، تجربه بارگذاری ، دستکاری و تجسم داده های بیولوژیکی با مجموعه ای مرتب از بسته های زبان R را ارائه می دهد. داده های نمونه مورد استفاده ، داده های RNA-seq است که در دسترس عموم می باشد. بنابراین شرکت کنندگان در ساختار و ظاهر داده های RNA-seq جستجو خواهند کرد. این کارگاه توسط متخصصان آموزش دهنده در مجموعه زیست رایان کیمیا توسعه یافته است.

اهداف یادگیری

در پایان این کارگاه آموزشی ، می توانید مهارت های زیر را انجام دهید:

• بارگذاری داده های جداول در R
• اعمال توابع tidyverse برای دستکاری داده ها در R
• تولید قطعات ساده ای مانند جعبه پلات با استفاده از ggplot
• درک و اعمال داده ها در ggplot
• اصلاح یک طرح ggplot
• معرفی متغیرها و توابع، نحوه عملکرد توابع و اصلاح استدلال ها برای استفاده در موارد خاص
• دستیابی به دسته ای از ساختارهای داده و انواع داده های مورد استفاده R
• خواندن داده ها از پرونده، استفاده از شاخص ها و توابع مختلف برای زیر مجموعه ها، ادغام و ایجاد مجموعه داده ها
• ایجاد جداول جدید داده برای استفاده در خارج از محیط R

الزامات و آمادگی ها

شرکت کنندگان باید از  لپ تاپ و اینترنت برای حضور آنلاین در کارگاه ها استفاده کنند.

حداقل یک هفته قبل از کارگاه ، شرکت کنندگان باید نرم افزار و فایل های زیر نصب کنند. این امر باید با دقت و زمان کافی انجام شود تا در صورت مواجه شدن با مشکلات فنی با پشتیبان فناوری اطلاعات خود ارتباط برقرار کنند.

قبل از شروع کارگاه ، لپ تاپ خود را برای موارد زیر آماده کنید:

1. نرم افزار R را بارگیری و نصب کنید.
2. RSTUDIO را در رایانه خود بارگیری و نصب کنید.
3. دستورالعمل های دقیق برای نصب R و RStudio در اینجا موجود است.

نرم افزارهای مورد نیاز برنامه نویسی R

• R
• استودیو

داده های مورد نیاز

• فایل داده ها را می توانید از اینجا بارگیری کنید.
• پیوندهای بارگیری داده های مورد نیاز نیز در PDF کارگاه موجود است .

مطالب کارگاه

مطالب مفصل کارگاه ، از جمله پیوندهای بارگیری داده ها ، به دو صورت موجود است:

نسخه HTML

نسخه PDF